COVID-19 pandemisi, nükleik asitlerin tespiti konusunda birçok yöntemin gelişmesine ivme kazandırdı. Bu bağlamda, “döngü aracılı izotermal amplifikasyon” (LAMP), basit ve hızlı çalışma prensibi sayesinde popüler bir tespit yöntemi haline geldi. LAMP yöntemi ile, New England Biolabs® tarafından üretilen *WarmStart® Colorimetric LAMP 2X Master Mix* kullanılarak insan apolipoprotein L1 geninin (ApoL1) sadece 30 dakika içinde Eppendorf ThermoMixer® C ve Eppendorf ThermoTop® ile tespiti sağlanmıştır. Hatta sadece 0.1 ng gibi düşük miktarlarda DNA şablonları bile, inkübasyon süresi 45 dakikaya çıkarılarak başarıyla tespit edilebilmiştir.
LAMP, nükleik asitlerin izotermal koşullar altında sürekli olarak amplifiye edilmesini sağlayan bir tekniktir. 2000 yılında Notomi ve arkadaşları tarafından geliştirilen bu yöntem, özellikle denatürasyon aşamasını gerektirmemesi ve istenilen genetik materyalin hızlı bir şekilde çoğaltılabilmesi nedeniyle dikkat çekmektedir. LAMP yöntemi ayrıca, RNA tespiti için ters transkriptaz eklenerek kullanılabilir ve sonuçlar, zamandan tasarruf sağlayan renk değişimleri ile gözlemlenebilir. Bu uygulamada, insan ApoL1 geni iki farklı polimeraz ile amplifiye edilmiş ve tespit hassasiyeti incelenmiştir. Elde edilen sonuçlara göre, LAMP yöntemi renk değişimi gözlemlenerek hızlı bir şekilde sonuç verebilmiştir. *WarmStart Colorimetric LAMP 2X Master Mix* ile 0.1 ng kadar düşük DNA miktarları, inkübasyon süresinin uzatılması ile tespit edilebilmiştir.
Testte kullanılan renk değişim yöntemi, hızlı sonuç alınabilmesini sağlamıştır. Özellikle 100 ng, 50 ng ve 10 ng DNA şablonları 25 dakikada renk değiştirerek pozitif sonuç vermiştir. 0.1 ng şablon ise 45 dakika sonunda pozitif olarak belirlenmiştir. Ayrıca, deney sonuçları, PCR yöntemine kıyasla LAMP yönteminin daha hızlı sonuç verdiğini ve jel elektroforezi gibi zaman alıcı ek adımlara ihtiyaç duymadığını göstermektedir.nükleik asit tespiti için hızlı ve hassas bir yöntem olarak öne çıkmaktadır. 30 dakika gibi kısa bir sürede pozitif sonuç verebilmesi ve jel elektroforezi gerektirmemesi, bu tekniğin pratik uygulamalarda tercih edilmesini sağlayacaktır. Özellikle, düşük maliyetli boyalar ile kitlerin optimize edilmesi, bu yöntemi PCR'ye kıyasla daha ekonomik hale getirebilir.
